Nanomaterials logo

Жидкие кристаллы и их практическое использование

Zhidkie kristally i ikh prakticheskoe ispol'zovanie

Liquid Crystals and their Application
Russian Journal

IvSU logo
Rus Eng

Меню

Наша группа ВКонтакте

Дорогие авторы и читатели!
Мы рады вам сообщить, что журнал включен в базы данных Web of Science (Emerging Sources Citation Index) и Scopus.

Journal



Жидк. крист. и их практич. использ. 2014.Том 14. Номер 1. Страницы 87—93.





Алгоритмы расчета ван-дер-ваальсовых взаимодействий для метода молекулярной динамики на графических устройствах. Оценка их эффективности



УДК 519.876.5

Д. О. Москвин, В. В. Соцкий, Н. В. Усольцева

Контактная информация
НИИ наноматериалов, Ивановский государственный университет,
ул. Ермака, 39, 153025 Иваново, Россия. 
E-mail: Moskvin1987@mail.ru

Аннотация
В настоящей работе рассматривается проблема переноса алгоритма списков Верле и алгоритма присоединенных списков расчета ван-дер-ваальсовых взаимодействий для метода молекулярной динамики на графические устройства, оценивается эффективность адаптированных алгоритмов. Показано, что алгоритмы списков Верле и присоединенных списков, выполняющие вычисления на графических устройствах в 39,5 и 10 раз, соответственно, эффективнее алгоритмов, рассчитывающих ван-дер-ваальсовы взаимодействия на 4-х центральных процессорах (распределение вычислений выполнено при помощи библиотеки OpenMP).

Ключевые слова: ван-дер-ваальсовы взаимодействия, молекулярная динамика, списки Верле, присоединенные списки, графические устройства.





Связь с веб-мастером