Уважаемые авторы и читатели!
Рады вам сообщить, что журнал прошел переаттестацию в Роскомнадзоре.

Наша группа ВКонтакте

УДК 519.876.5

Д. О. Москвин, В. В. Соцкий, Н. В. Усольцева

Контактная информация
НИИ наноматериалов, Ивановский государственный университет,
ул. Ермака, 39, 153025 Иваново, Россия. 
E-mail: Moskvin1987@mail.ru

Аннотация
В настоящей работе рассматривается проблема переноса алгоритма списков Верле и алгоритма присоединенных списков расчета ван-дер-ваальсовых взаимодействий для метода молекулярной динамики на графические устройства, оценивается эффективность адаптированных алгоритмов. Показано, что алгоритмы списков Верле и присоединенных списков, выполняющие вычисления на графических устройствах в 39,5 и 10 раз, соответственно, эффективнее алгоритмов, рассчитывающих ван-дер-ваальсовы взаимодействия на 4-х центральных процессорах (распределение вычислений выполнено при помощи библиотеки OpenMP).

Ключевые слова: ван-дер-ваальсовы взаимодействия, молекулярная динамика, списки Верле, присоединенные списки, графические устройства.